20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3066 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  45.87 
 
 		 185 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  43.93 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  45.87 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  43.24 
 
 		 172 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  42.34 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  46.79 
 
 		 184 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  36.36 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  38.39 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  39.82 
 
 		 364 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  30.63 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  34.23 
 
 		 364 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  33.93 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  36.94 
 
 		 378 aa  62  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  39.53 
 
 		 918 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  33.04 
 
 		 350 aa  57.4  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  32.14 
 
 		 210 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  29.52 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  24.56 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>