More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0789 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2936  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  62.29 
 
 		 541 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4059  aldehyde dehydrogenase  60.89 
 
 		 542 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.739878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0818  aldehyde dehydrogenase family protein  77.08 
 
 		 541 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3408  aldehyde dehydrogenase  60.7 
 
 		 542 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.828845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2516  Aldehyde Dehydrogenase  60.63 
 
 		 541 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3443  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative  62.99 
 
 		 539 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.381863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1033  aldehyde dehydrogenase  74.68 
 
 		 541 aa  840    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2859  aldehyde dehydrogenase  59.22 
 
 		 540 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.209898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2493  aldehyde dehydrogenase  63.93 
 
 		 539 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.442503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3462  aldehyde dehydrogenase  60.89 
 
 		 542 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0162  aldehyde dehydrogenase  58.21 
 
 		 536 aa  640    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.396114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2068  aldehyde dehydrogenase  56.64 
 
 		 542 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.72096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1087  aldehyde dehydrogenase  65.43 
 
 		 540 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1707  Aldehyde Dehydrogenase_  64.01 
 
 		 539 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.595433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1289  Aldehyde Dehydrogenase  60.26 
 
 		 541 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.657181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34600  putative glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  62.48 
 
 		 541 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.204448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2492  aldehyde dehydrogenase  60.81 
 
 		 541 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149114  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22040  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  63.35 
 
 		 534 aa  706    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2926  aldehyde dehydrogenase  63.74 
 
 		 539 aa  707    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.131845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2693  aldehyde dehydrogenase  61.07 
 
 		 542 aa  699    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0798  Aldehyde Dehydrogenase  60.23 
 
 		 540 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.397538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0789  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 541 aa  1107    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2515  Aldehyde Dehydrogenase  63.82 
 
 		 539 aa  724    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27210  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  63.22 
 
 		 541 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2144  aldehyde dehydrogenase  65.12 
 
 		 546 aa  743    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2271  Aldehyde Dehydrogenase  60.26 
 
 		 541 aa  682    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0315969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49950  Aldehyde dehydrogenase  62.85 
 
 		 541 aa  702    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.489954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2321  aldehyde dehydrogenase  63.18 
 
 		 539 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0301  gyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  61.6 
 
 		 545 aa  718    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5240  aldehyde dehydrogenase  60.7 
 
 		 542 aa  697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5161  aldehyde dehydrogenase  60.52 
 
 		 569 aa  692    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.664596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1780  Aldehyde Dehydrogenase  59.18 
 
 		 560 aa  634  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.760997 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1385  Aldehyde Dehydrogenase  56.84 
 
 		 524 aa  633  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.354292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4869  aldehyde dehydrogenase  57.14 
 
 		 526 aa  625  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0146679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45780  Aldehyde dehydrogenase  63.61 
 
 		 459 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_54378  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  43.7 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  33.26 
 
 		 479 aa  237  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.8 
 
 		 477 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  32.81 
 
 		 479 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.57 
 
 		 479 aa  236  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  32.57 
 
 		 479 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  32.57 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  33.41 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  32.35 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  33.18 
 
 		 482 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  32.41 
 
 		 476 aa  227  4e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  31.68 
 
 		 471 aa  226  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  31.29 
 
 		 457 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  31.31 
 
 		 475 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  33.08 
 
 		 475 aa  210  4e-53  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  30.24 
 
 		 472 aa  209  8e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  32.21 
 
 		 482 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  32.59 
 
 		 477 aa  204  4e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  29.29 
 
 		 484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  29.41 
 
 		 484 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  29.19 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  29.31 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 		 484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  29.08 
 
 		 484 aa  167  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.15 
 
 		 484 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1629  Aldehyde Dehydrogenase  32.02 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  27.78 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  27.97 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  29.08 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4370  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  27.97 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  28.11 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3488  Aldehyde Dehydrogenase  31.57 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  28.38 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 		 477 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  30.52 
 
 		 477 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  30.05 
 
 		 478 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  28.06 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3221  aldehyde dehydrogenase  29.45 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  28.73 
 
 		 484 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  30.18 
 
 		 486 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  28.09 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  27.02 
 
 		 498 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  26.49 
 
 		 455 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  28.88 
 
 		 483 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  28.03 
 
 		 475 aa  157  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2307  Aldehyde Dehydrogenase  27.33 
 
 		 486 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  28.74 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  27.78 
 
 		 479 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  28.17 
 
 		 505 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  28.31 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  28.09 
 
 		 479 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  27.47 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>