28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0114 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0200931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0312  hypothetical protein  72.83 
 
 		 92 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1954  type IV pilus assembly PilZ  46.07 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3538  type IV pilus assembly PilZ  37.17 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.95564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1008  type IV pilus assembly PilZ  31.53 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.040213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3298  type IV pilus assembly PilZ  33.33 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000457496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3252  type IV pilus assembly PilZ  31.53 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0923  type IV pilus assembly PilZ  31.45 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3128  type IV pilus assembly PilZ  44.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1134  type IV pilus assembly PilZ  44.32 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0336  type IV pilus assembly PilZ  40.66 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11727  normal  0.442913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0950  type IV pilus assembly PilZ  31.86 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0622981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1192  hypothetical protein  33.61 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0114728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3900  hypothetical protein  40.96 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.121911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2430  type IV pilus assembly PilZ  30.77 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.232647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0577  type IV pilus assembly PilZ  29.47 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0997  type IV pilus assembly PilZ  30.14 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0266  hypothetical protein  25.41 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.485965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00996  hypothetical protein  30 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004403  hypothetical protein  31.11 
 
 		 122 aa  48.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.364694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0837  type IV pilus assembly PilZ  27.47 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.699078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1430  type IV pilus assembly PilZ  28.71 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1050  type IV pilus assembly PilZ  27.78 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.418189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2523  hypothetical protein  28.26 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000798517  normal  0.122519 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0228  hypothetical protein  27.47 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2804  type IV pilus assembly PilZ  28.57 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0656  putative signaling protein  25.27 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1011  type IV pilus assembly PilZ  26.09 
 
 		 121 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>