14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1417 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  57.53 
 
 
259 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  51.57 
 
 
286 aa  275  5e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  51.18 
 
 
278 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  50.39 
 
 
266 aa  251  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  50.98 
 
 
260 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  40.62 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  33.2 
 
 
275 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0969  hypothetical protein  39.32 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  54.55 
 
 
164 aa  112  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  30.25 
 
 
286 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  23.95 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  23.85 
 
 
276 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  25.88 
 
 
276 aa  42.7  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>