37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0410 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0410  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0352  hypothetical protein  58.45 
 
 
289 aa  344  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.819934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0333  hypothetical protein  58.45 
 
 
289 aa  343  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3662299999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3009  hypothetical protein  56.79 
 
 
285 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17787  normal  0.91489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0608  hypothetical protein  59.71 
 
 
285 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0025  hypothetical protein  57.46 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0524  hypothetical protein  56.52 
 
 
235 aa  267  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.418393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0347  hypothetical protein  41.13 
 
 
270 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.222932  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1392  hypothetical protein  40.91 
 
 
326 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2557  hypothetical protein  41.79 
 
 
329 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1291  hypothetical protein  41.42 
 
 
329 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191656  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2841  hypothetical protein  36.36 
 
 
260 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1510  hypothetical protein  35.88 
 
 
256 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000524399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2123  hypothetical protein  35.96 
 
 
264 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135949  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1306  hypothetical protein  43.87 
 
 
336 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668122  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5052  hypothetical protein  35.36 
 
 
266 aa  156  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.610443  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0495  hypothetical protein  35.06 
 
 
257 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3045  hypothetical protein  35.63 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184517 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0660  hypothetical protein  33.72 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0537  hypothetical protein  28.3 
 
 
269 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00291593  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08066  hypothetical protein  28.24 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1579  hypothetical protein  36.68 
 
 
267 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000340364  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1578  hypothetical protein  34.62 
 
 
249 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2907  hypothetical protein  34.59 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0604  hypothetical protein  32.69 
 
 
266 aa  132  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0709  hypothetical protein  31.45 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000170117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1147  hypothetical protein  33.6 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2453  hypothetical protein  28.2 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.683144  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1137  hypothetical protein  30.89 
 
 
251 aa  122  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0787  hypothetical protein  31.45 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.914864  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0395  hypothetical protein  29.88 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1641  hypothetical protein  29.55 
 
 
254 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0721  hypothetical protein  31.17 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.660165  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0101  hypothetical protein  29.45 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1815  hypothetical protein  28.74 
 
 
254 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1461  hypothetical protein  41.43 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1460  hypothetical protein  24.57 
 
 
177 aa  49.3  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>