18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3573 on replicon NC_011367
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011367  Gdia_3573  Conjugal transfer TraD family protein  100 
 
 		 90 aa  178  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0328  conjugal transfer TraD family protein  58.67 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3193  conjugal transfer TraD  58.44 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1150  conjugal transfer TraD family protein  58.67 
 
 		 76 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0126783  hitchhiker  0.0000022316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  53.09 
 
 		 81 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0180  conjugal transfer TraD family protein  80 
 
 		 87 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1545  conjugal transfer TraD  49.38 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358728  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  48.84 
 
 		 89 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0147  conjugal transfer TraD  48.68 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3948  conjugal transfer TraD  49.38 
 
 		 89 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  66 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0098  conjugal transfer TraD family protein  48.68 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  46.05 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  46.05 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  62.75 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  47.95 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  47.37 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0996  conjugal transfer TraD  41.76 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000550634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>