17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2725 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2725  integrase family protein  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.15967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1536  phage integrase  49.29 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.26915 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0330  integrase family protein  43.57 
 
 		 193 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0342  integrase family protein  41.84 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0178  phage integrase family protein  40.72 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4683  integrase family protein  40.72 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2340  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 311 aa  45.1  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002936  DET0157  phage integrase family site specific recombinase  40.98 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  41.56 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0016  Phage integrase  32.56 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0260754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4838  tyrosine recombinase  37.5 
 
 		 200 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  40.85 
 
 		 326 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4538  tyrosine recombinase  37.5 
 
 		 200 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000945122  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5818  tyrosine recombinase  37.5 
 
 		 200 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.855252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04141  hypothetical protein  37.5 
 
 		 159 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3686  integrase family protein  37.5 
 
 		 200 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.73173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>