38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1659 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1659    100 
 
 		 240 bp  476  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4611    89.42 
 
 		 387 bp  238  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0616505 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3989  IS3 family transposase  84.36 
 
 		 498 bp  157  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7504  IS3 family transposase  83.89 
 
 		 858 bp  149  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7697    83.97 
 
 		 153 bp  93.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248811  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7468    83.97 
 
 		 153 bp  93.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1494  hypothetical protein  84.09 
 
 		 693 bp  87.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  85.58 
 
 		 798 bp  87.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  85.58 
 
 		 798 bp  87.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  85.58 
 
 		 798 bp  87.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  85.58 
 
 		 798 bp  87.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2715  IS3 family transposase  85.96 
 
 		 135 bp  83.8  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  85.9 
 
 		 819 bp  67.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  85.9 
 
 		 849 bp  67.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  85.9 
 
 		 849 bp  67.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2810  integrase  82.83 
 
 		 843 bp  61.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 840 bp  61.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 840 bp  61.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 840 bp  61.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 840 bp  61.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  88.14 
 
 		 840 bp  61.9  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  87.1 
 
 		 705 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  87.1 
 
 		 705 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  87.1 
 
 		 918 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  82.35 
 
 		 843 bp  60  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  87.1 
 
 		 705 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  87.1 
 
 		 918 bp  60  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1458    87.27 
 
 		 867 bp  54  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.228628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4343    94.29 
 
 		 816 bp  54  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  84.62 
 
 		 828 bp  50.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  84.62 
 
 		 828 bp  50.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  82.02 
 
 		 846 bp  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  84.62 
 
 		 828 bp  50.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  84.62 
 
 		 828 bp  50.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51540  putative transposase  93.75 
 
 		 570 bp  48.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000532814  hitchhiker  0.0000365126 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2757    96.43 
 
 		 786 bp  48.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  100 
 
 		 843 bp  46.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28750  hypothetical protein  91.43 
 
 		 375 bp  46.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000102722  decreased coverage  0.000000000142523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>