More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0445 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0445  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
123 aa  251  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.361267  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1362  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.55 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  50.93 
 
 
113 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.43 
 
 
108 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.3 
 
 
109 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  47.79 
 
 
110 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  49.07 
 
 
110 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  49.07 
 
 
109 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  48.67 
 
 
110 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.86 
 
 
108 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  53.33 
 
 
124 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  45.54 
 
 
108 aa  100  9e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  45.54 
 
 
108 aa  100  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.05 
 
 
111 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.74 
 
 
110 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.86 
 
 
108 aa  99  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  52.29 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.67 
 
 
110 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.55 
 
 
108 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  42.2 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.18 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.64 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.64 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.22 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
123 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.23 
 
 
102 aa  96.7  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  46.02 
 
 
110 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.06 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
108 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.17 
 
 
123 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.44 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.17 
 
 
123 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.54 
 
 
108 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
116 aa  95.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.84 
 
 
121 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.73 
 
 
120 aa  94.7  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
122 aa  94.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.31 
 
 
130 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
107 aa  94.4  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.44 
 
 
115 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
123 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  51.82 
 
 
109 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  39.5 
 
 
117 aa  94  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
123 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.64 
 
 
116 aa  94  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
123 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
116 aa  93.6  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  47.71 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.27 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.02 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.2 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.02 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.37 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.71 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.98 
 
 
110 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.31 
 
 
116 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  41.07 
 
 
116 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.07 
 
 
116 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.3 
 
 
148 aa  92  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.35 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.19 
 
 
120 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.03 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  43.52 
 
 
110 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.03 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.1 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.5 
 
 
122 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  37.1 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.32 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.19 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.94 
 
 
120 aa  90.5  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.19 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.19 
 
 
132 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  41.75 
 
 
116 aa  90.1  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.02 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.52 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.75 
 
 
121 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  38.02 
 
 
124 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0879  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.38 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216365  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.45 
 
 
117 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  42.02 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.17 
 
 
128 aa  89.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  37.21 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  39.17 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.29 
 
 
124 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2109  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.57 
 
 
124 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.38 
 
 
121 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40.5 
 
 
118 aa  89  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  50 
 
 
106 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.75 
 
 
121 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.87 
 
 
106 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  36.67 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>