More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3909 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  54.51 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  54.51 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  56.43 
 
 		 685 aa  745    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  55.34 
 
 		 679 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  54.75 
 
 		 690 aa  707    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  59.14 
 
 		 682 aa  802    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  55.49 
 
 		 738 aa  713    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  55.38 
 
 		 714 aa  750    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.18 
 
 		 682 aa  701    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  54.64 
 
 		 699 aa  708    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  55.54 
 
 		 686 aa  683    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  59.08 
 
 		 686 aa  813    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  52.19 
 
 		 802 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  54.81 
 
 		 687 aa  711    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  55.26 
 
 		 680 aa  723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  59.65 
 
 		 692 aa  812    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  54.16 
 
 		 684 aa  706    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  55.29 
 
 		 679 aa  733    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  59.74 
 
 		 704 aa  820    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  57.39 
 
 		 716 aa  774    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  100 
 
 		 678 aa  1382    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  55.64 
 
 		 679 aa  719    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  54.51 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  56.21 
 
 		 681 aa  718    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  54.22 
 
 		 683 aa  686    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  54.34 
 
 		 689 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  56.23 
 
 		 678 aa  726    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  55.79 
 
 		 690 aa  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  53.96 
 
 		 681 aa  715    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  55.19 
 
 		 690 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  54.51 
 
 		 680 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  55.83 
 
 		 680 aa  734    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  59.23 
 
 		 691 aa  796    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  46.36 
 
 		 642 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  45.01 
 
 		 645 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  46.51 
 
 		 652 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  44.02 
 
 		 635 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  43.57 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  42.77 
 
 		 647 aa  527  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  42.56 
 
 		 647 aa  521  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  44.93 
 
 		 676 aa  516  1.0000000000000001e-145  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  43.56 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  58.5 
 
 		 846 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.52 
 
 		 650 aa  303  7.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  31.01 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.06 
 
 		 583 aa  191  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  29.04 
 
 		 576 aa  184  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  29.04 
 
 		 576 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.6 
 
 		 566 aa  180  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.6 
 
 		 566 aa  180  7e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  29.26 
 
 		 587 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.3 
 
 		 566 aa  174  5e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.83 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  30.17 
 
 		 567 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.8 
 
 		 542 aa  161  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  24.96 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.63 
 
 		 542 aa  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  27.27 
 
 		 547 aa  154  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  26.87 
 
 		 566 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.8 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  27.41 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  26.81 
 
 		 545 aa  152  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  28.52 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  29.07 
 
 		 598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  26.95 
 
 		 545 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.82 
 
 		 543 aa  147  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  26.27 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.36 
 
 		 543 aa  145  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  25.78 
 
 		 544 aa  144  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  28.08 
 
 		 548 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  24.31 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  24.77 
 
 		 686 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.68 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  26.89 
 
 		 552 aa  142  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  24.96 
 
 		 561 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  24.92 
 
 		 688 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  24.88 
 
 		 561 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.44 
 
 		 591 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  24.48 
 
 		 561 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  25.04 
 
 		 577 aa  138  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  24.63 
 
 		 561 aa  137  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  25.33 
 
 		 700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.57 
 
 		 577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.15 
 
 		 658 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  27.19 
 
 		 577 aa  134  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.28 
 
 		 567 aa  134  6e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2968  NAD+ synthetase  28.33 
 
 		 577 aa  133  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  27.18 
 
 		 567 aa  133  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  28.08 
 
 		 584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  28.13 
 
 		 571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3585  NAD+ synthetase  28.8 
 
 		 586 aa  133  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  25.71 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  23.44 
 
 		 626 aa  132  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  22.1 
 
 		 561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  27.78 
 
 		 539 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0246  NAD+ synthetase  28.88 
 
 		 571 aa  130  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  23.74 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0495  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.38 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.2 
 
 		 591 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.65 
 
 		 577 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>