22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3184 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3184  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  40.91 
 
 		 431 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0634  hypothetical protein  37.79 
 
 		 422 aa  212  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0152  hypothetical protein  32.92 
 
 		 404 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  32.47 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1448  hypothetical protein  35.37 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  32.92 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1455  hypothetical protein  32 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0633  hypothetical protein  30.19 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4418  hypothetical protein  28.3 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  27.34 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3925  hypothetical protein  30.63 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  24.71 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  24.6 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4094  hypothetical protein  23.72 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  24.06 
 
 		 346 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1773  hypothetical protein  26.47 
 
 		 787 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.488982 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  23.7 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5633  hypothetical protein  26.32 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  50 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4088  hypothetical protein  31.41 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00189441  normal  0.318027 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3919  hypothetical protein  31.41 
 
 		 330 aa  43.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>