23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2665 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2667    100 
 
 
5883 bp  11660    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2666  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
789 bp  1564    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2665    100 
 
 
7798 bp  15460    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2626  cation diffusion facilitator family transporter  96.53 
 
 
942 bp  985    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208162  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0817    98.42 
 
 
4523 bp  2236    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    98.42 
 
 
3753 bp  2236    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  80.27 
 
 
720 bp  283  4e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3899    84.39 
 
 
405 bp  258  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1214  IstB domain protein ATP-binding protein  87.44 
 
 
534 bp  204  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0664898  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0368  hypothetical protein  100 
 
 
363 bp  159  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4903  cation diffusion facilitator family transporter  84.25 
 
 
927 bp  93.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3895  hypothetical protein  79.59 
 
 
393 bp  89.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.389785 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4570  cation diffusion facilitator family transporter  85.39 
 
 
1023 bp  73.8  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  89.83 
 
 
1494 bp  69.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  89.09 
 
 
1497 bp  61.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4273  IstB domain protein ATP-binding protein  88.89 
 
 
792 bp  60  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    90.7 
 
 
2912 bp  54  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0497  putative cation efflux system protein  96.67 
 
 
900 bp  52  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25900  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
915 bp  50.1  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4107  hypothetical protein  93.94 
 
 
765 bp  50.1  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.408855  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4544  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
1071 bp  50.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.586592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  100 
 
 
1323 bp  50.1  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36700  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
942 bp  50.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.761376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>