16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2248 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2248  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  467  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1881  secreted alanine rich protein  43.83 
 
 
234 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.961705  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2464  hypothetical protein  38.79 
 
 
221 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3936  hypothetical protein  39.48 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2188  hypothetical protein  39.48 
 
 
218 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2234  hypothetical protein  39.48 
 
 
218 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108266  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2177  hypothetical protein  39.48 
 
 
218 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26652  hitchhiker  0.0018369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3762  hypothetical protein  38.35 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354938  normal  0.602962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12715  secreted alanine rich protein  40.6 
 
 
216 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0163225  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24300  hypothetical protein  37.6 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1512  hypothetical protein  34.21 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0234  hypothetical protein  28.34 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26330  hypothetical protein  33.65 
 
 
201 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04630  ACT domain-containing protein  30.3 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.424021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1477  hypothetical protein  26.42 
 
 
174 aa  42  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.258499  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1867  putative secreted alanine rich protein  32.35 
 
 
179 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.392204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>