21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0962 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0962  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.765265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4223  hypothetical protein  36.08 
 
 		 317 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4148  hypothetical protein  36.08 
 
 		 317 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4673  hypothetical protein  37.9 
 
 		 323 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  36.05 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4379  hypothetical protein  35.44 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.050134  normal  0.875695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3258  hypothetical protein  33.6 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12581  hypothetical protein  32.51 
 
 		 325 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.713228  normal  0.93141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3259  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2212  hypothetical protein  31.49 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32045  normal  0.0285303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1746  integral membrane protein  27.71 
 
 		 452 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.415451  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2197  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.481284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0661  hypothetical protein  24.56 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4020  hypothetical protein  27.76 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  35.81 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13380  predicted integral membrane protein  32.9 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271933  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1552  integral putative membrane protein  31.25 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2431  hypothetical protein  25.1 
 
 		 327 aa  48.9  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.297955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  27.69 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  23.77 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  25.25 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>