41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3696 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  100 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  98.15 
 
 		 162 aa  312  9e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  67.9 
 
 		 169 aa  209  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  55.83 
 
 		 178 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  51.27 
 
 		 178 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  40.28 
 
 		 163 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  32.45 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  40.67 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  30.58 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  34.11 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  28.66 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  34.86 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  28.78 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  29.75 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  32.31 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  35.78 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  34.86 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  34.86 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  31.29 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  27.01 
 
 		 190 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  28.87 
 
 		 207 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  31.78 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  23.21 
 
 		 196 aa  43.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  24.41 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  25.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  27.64 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  25.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  25.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  25.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  25.85 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  21.67 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  27.01 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  26.02 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  27.01 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  22.89 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  29.55 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  26.81 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  26.81 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  25.95 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  27.21 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  25 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>