15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3235 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3235  transport-associated  100 
 
 		 147 aa  287  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.026553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1030  transport-associated protein  90.91 
 
 		 150 aa  237  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1119  putative phophoslipid binding protein  47.79 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000111186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1191  transport-associated  59.76 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2741  transport-associated protein  38.97 
 
 		 140 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2750  transport-associated protein  43.75 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0068  hypothetical protein  41.67 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.686512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3144  transport-associated  34.38 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6692  transport-associated  26.98 
 
 		 543 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4411  transport-associated  35.19 
 
 		 244 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6356  transport-associated  34.25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.802203  normal  0.334542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2966  periplasmic or secreted lipoprotein OsmY  30 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4381  transport-associated protein  29.41 
 
 		 308 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3022  transport-associated  31.58 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  0.200341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3033  putative phophoslipid binding protein  29.17 
 
 		 249 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.435467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>