114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3177 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  355  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  98.82 
 
 
170 aa  350  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  78.4 
 
 
170 aa  275  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  67.07 
 
 
164 aa  237  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  53.85 
 
 
188 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  45.58 
 
 
213 aa  157  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.268163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0266  acetyltransferase-like  43.79 
 
 
223 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.879023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3344  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.6 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.86 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0757  hypothetical protein  30.08 
 
 
151 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.365522  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.54 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0345  GCN5-related N-acetyltransferase  23.13 
 
 
251 aa  51.6  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1238  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3123  GCN5-related N-acetyltransferase  23.94 
 
 
249 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0630  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.75 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1253  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
294 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1420  hypothetical protein  30 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0035  acetyltransferase  26.95 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00435324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2427  GCN5-related N-acetyltransferase  23.7 
 
 
292 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2100  acetyltransferase, GNAT family  27.63 
 
 
165 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.7 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1922  acetyltransferase  26.97 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.277124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1884  acetyltransferase  26.97 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.364881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.53 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2069  acetyltransferase  26.97 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.73 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
323 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3852  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4020  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.388573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2948  streptothricin acetyltransferase  26.72 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131684  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2155  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.6 
 
 
154 aa  44.7  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0068043  hitchhiker  0.000372679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0790  GCN5-related N-acetyltransferase  21.13 
 
 
249 aa  44.3  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
166 aa  44.3  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  29.67 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1874  acetyltransferase  26.32 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.39507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0563  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  29.67 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5778  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225657  normal  0.0101092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  26.87 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000199537  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  29.67 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  21.88 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1105  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17430  acetyltransferase  28.72 
 
 
317 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.142299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0028  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0385  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  21.9 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.449892  normal  0.0950739 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.6 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1335  sortase related acyltransferase  22.76 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000322304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0616  GCN5-related N-acetyltransferase  23.73 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.120941  normal  0.314865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4224  GCN5-related N-acetyltransferase  23.42 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3462  putative acetyltransferase  26.12 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4242  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.12 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.0137712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2417  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
282 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160018  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  26.83 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  25.95 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  25.6 
 
 
297 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435481  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02334  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0250  acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.416446  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  30.43 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  22.56 
 
 
292 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2571  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2720  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2589  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1441  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3664  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.863704  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.03 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2853  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590433  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  28.57 
 
 
323 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1703  GCN5-related N-acetyltransferase  22.73 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.573614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1784  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
153 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02296  hypothetical protein  24.63 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1227  GCN5-related N-acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  25.37 
 
 
162 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
174 aa  42  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1245  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.756848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0119  acetyltransferase  21.8 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  24.58 
 
 
155 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0105  acetyltransferase  26.27 
 
 
135 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1556  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
168 aa  41.6  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0661406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.46 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2069  putative streptothricin acetyltransferase  30.11 
 
 
185 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6035  Gentamicin 3'-N-acetyltransferase  23.13 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37660  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  27.2 
 
 
306 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3210  putative acetyltransferase  25.37 
 
 
141 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3289  putative acetyltransferase  24.63 
 
 
141 aa  41.2  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.834546  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  27.41 
 
 
150 aa  41.2  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.91 
 
 
176 aa  40.8  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>