41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2813 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1441  GCN5-related N-acetyltransferase  97.26 
 
 
146 aa  293  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  64.83 
 
 
148 aa  197  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  61.7 
 
 
155 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
159 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 
168 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
159 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.91 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2155  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.01 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0068043  hitchhiker  0.000372679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
318 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  24.53 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  24.2 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  23.78 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  26.57 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.93 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  27.97 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3344  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
205 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  23.72 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  20.98 
 
 
153 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.76 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.71 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
174 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  23.75 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2961  acetyltransferase protein  29.41 
 
 
160 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2946  GCN5-related N-acetyltransferase  24.14 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  25.55 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0485  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535173  normal  0.634598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  22.66 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0374  GCN5-related N-acetyltransferase  27.55 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.918937  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
247 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0689  acetyltransferase  24 
 
 
155 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00474298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>