48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2961 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2961  acetyltransferase protein  100 
 
 
160 aa  331  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2105  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14540  sortase-like acyltransferase  44.81 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.211853  normal  0.158837 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4746  GCN5-related N-acetyltransferase  40.97 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.122801 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4667  GCN5-related N-acetyltransferase  39.58 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0672  acetyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.722792  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4072  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.232011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  35.46 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  28.87 
 
 
166 aa  51.2  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0672  GCN5-related N-acetyltransferase  24.66 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.682973  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06373  hypothetical protein  25.85 
 
 
184 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0859  putative acetyltransferase  35.53 
 
 
177 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0426364 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0574  hypothetical protein  35.16 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4546  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132428  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0621  acetyltransferase, GNAT family  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4718  acetyltransferase, GNAT family  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0639  acetyltransferase, GNAT family  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0709  acetyltransferase, GNAT family  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0583  acetyltransferase  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0496  acetyltransferase  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0494  acetyltransferase  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.226849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0552  acetyltransferase  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0647  acetyltransferase  28.26 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14911  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000877  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  27.27 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.929276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0497  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  26.72 
 
 
168 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0499  acetyltransferase  26.72 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  25.86 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  25.86 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3123  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
249 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0683  GCN5-related N-acetyltransferase  27.18 
 
 
152 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00199823  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0374  GCN5-related N-acetyltransferase  27.45 
 
 
155 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.918937  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  25.86 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  25.86 
 
 
168 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  25.86 
 
 
168 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2157  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
163 aa  42  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  25.86 
 
 
168 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  25.86 
 
 
168 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0659  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0910  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
165 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329929  normal  0.100371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1685  phosphinothricin acetyltransferase  24.65 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0590147  normal  0.0881211 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2603  GCN5-related N-acetyltransferase  24.51 
 
 
172 aa  40.8  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.622402  normal  0.0984567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>