42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1022 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 159 aa  326  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  84.91 
 
 		 168 aa  283  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  73.58 
 
 		 159 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1441  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2946  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  30.94 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.62 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.52 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.635704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2611  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  25.55 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.22 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  23.71 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  29.29 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 		 170 aa  43.9  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  24 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.26 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.81 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3344  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 		 213 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.268163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3082  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 241 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  26.09 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2648  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.01 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.528414  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  26.53 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 174 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 247 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2806  putative acetyltransferase  23.78 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>