41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0731 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
159 aa  326  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  75.47 
 
 
168 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  73.58 
 
 
159 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  46.53 
 
 
148 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
146 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1441  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 
146 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
155 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2946  GCN5-related N-acetyltransferase  26.57 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.23 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
181 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
188 aa  50.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  27.82 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003605  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  27.62 
 
 
177 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.14 
 
 
152 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.97 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  23.66 
 
 
318 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3174  GCN5-related N-acetyltransferase  22.68 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.524081  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.12 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3573  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  31.43 
 
 
153 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2955  putative acetyltransferase  27.55 
 
 
162 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.68791  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0392  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.57 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  26.8 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0621  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
294 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0136  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.01 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8442  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0521175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2469  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.01 
 
 
183 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.83969  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
241 aa  41.2  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314403  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0865  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2385  putative acetyltransferase  27.35 
 
 
151 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.110426  normal  0.478401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  24.74 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
181 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.217746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>