40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1441 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1441  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2813  GCN5-related N-acetyltransferase  97.26 
 
 		 146 aa  293  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2096  GCN5-related N-acetyltransferase  65.52 
 
 		 148 aa  197  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2077  GCN5-related N-acetyltransferase  62.41 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0731  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1022  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288389  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.91 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 		 318 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3140  putative acetyltransferase  25.16 
 
 		 156 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0451024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2315  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0826  putative acetyltransferase  24.84 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2945  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0549  putative acetyltransferase  27.97 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2155  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  26.28 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0068043  hitchhiker  0.000372679 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2362  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.93 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  30.21 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0436  acetyltransferase  21.68 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  25.62 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06850  acetyltransferase  26.03 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6896  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3344  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2368  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.76 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0593  putative acetyltransferase  24.38 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.623078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 247 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 		 170 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 		 170 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25 
 
 		 176 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2612  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.413672  normal  0.492654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  27.46 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1771  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  22.66 
 
 		 173 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 		 174 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1411  GCN5-related N-acetyltransferase  25.55 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000201819  hitchhiker  0.000645315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 		 297 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0757  hypothetical protein  22.79 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.365522  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2946  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 167 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>