77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1420 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1420  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.397354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2546  GCN5-related N-acetyltransferase  60 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.520917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
174 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.884644  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4336  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2412  acetyltransferase  27.1 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0274  hypothetical protein  34.44 
 
 
164 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
153 aa  52.8  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.246804  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0672  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 
154 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.682973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
133 aa  48.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0774  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
151 aa  48.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.60492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3286  acetyltransferase  26 
 
 
149 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.867207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3177  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0233135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
368 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1086  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  25.4 
 
 
373 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
270 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  42.37 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0988  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
188 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803584  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  28.57 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  27.91 
 
 
365 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  28.12 
 
 
365 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.83 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  37.88 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
138 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2631  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.512633  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0611  acetyltransferase  34.95 
 
 
155 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3326  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
396 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.975468  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1670  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0331323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1559  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0638  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.26 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003788  transcriptional regulator  28.57 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00106887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0950  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  27.64 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0801  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.81 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1553  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0158841  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0942  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
191 aa  42.7  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3689  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.950669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1576  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1528  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.852993  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
183 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0592  GCN5-related N-acetyltransferase  27.04 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1096  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
171 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
167 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.67 
 
 
378 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.291701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  27.68 
 
 
364 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2682  GCN5-related N-acetyltransferase  25.42 
 
 
152 aa  42  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000369488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
151 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
364 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0826  GCN5-related N-acetyltransferase  28.42 
 
 
213 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.268163 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4361  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
174 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.227098  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1061  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
148 aa  42  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1472  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
152 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12684  hypothetical protein  29.81 
 
 
156 aa  41.6  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
172 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.66 
 
 
148 aa  41.6  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0828  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
147 aa  41.6  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0335  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.995341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34.48 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2886  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.7 
 
 
159 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3724  GCN5-related N-acetyltransferase  29.91 
 
 
160 aa  41.2  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3698  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
160 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>