77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2260 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  100 
 
 		 280 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  94.29 
 
 		 280 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3686  hypothetical protein  59.09 
 
 		 132 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.829007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3125  hypothetical protein  58.33 
 
 		 132 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2773  protein of unknown function DUF302  58.33 
 
 		 132 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2368  hypothetical protein  48.41 
 
 		 131 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0210  protein of unknown function DUF302  48.46 
 
 		 130 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5680  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.18352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  46.03 
 
 		 128 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1910  hypothetical protein  55.24 
 
 		 114 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.468377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1382  protein of unknown function DUF302  43.75 
 
 		 133 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0692237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2890  hypothetical protein  42.06 
 
 		 128 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2724  protein of unknown function DUF302  45.24 
 
 		 131 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0628237  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  42.06 
 
 		 128 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0404  hypothetical protein  41.27 
 
 		 129 aa  115  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658565  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1892  protein of unknown function DUF302  43.65 
 
 		 134 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3031  protein of unknown function DUF302  40.48 
 
 		 138 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0505  protein of unknown function DUF302  46.15 
 
 		 136 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3932  hypothetical protein  42.11 
 
 		 129 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4042  protein of unknown function DUF302  43.1 
 
 		 129 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4074  protein of unknown function DUF302  43.1 
 
 		 129 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  44.72 
 
 		 135 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0540  hypothetical protein  40.31 
 
 		 135 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4018  hypothetical protein  40.94 
 
 		 133 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4093  hypothetical protein  40.94 
 
 		 133 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4248  hypothetical protein  40.94 
 
 		 133 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472325  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1108  protein of unknown function DUF302  45.24 
 
 		 128 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.171345  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0833  protein of unknown function DUF302  38.58 
 
 		 141 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.134961  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2156  hypothetical protein  40.16 
 
 		 131 aa  103  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.612651  normal  0.115283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3053  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2206  hypothetical protein  37.06 
 
 		 148 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0500  hypothetical protein  40.52 
 
 		 123 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227821  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  41.23 
 
 		 128 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  41.23 
 
 		 128 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2073  protein of unknown function DUF302  39.68 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2447  hypothetical protein  39.68 
 
 		 131 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  40.71 
 
 		 128 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  40.71 
 
 		 128 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3468  hypothetical protein  38.46 
 
 		 129 aa  96.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0981  hypothetical protein  37.98 
 
 		 131 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  37.8 
 
 		 137 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0925  protein of unknown function DUF302  36.89 
 
 		 131 aa  95.5  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4478  hypothetical protein  37.21 
 
 		 131 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1826  hypothetical protein  38.76 
 
 		 137 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5390  hypothetical protein  38.93 
 
 		 135 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5410  hypothetical protein  38.93 
 
 		 135 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0504  hypothetical protein  38.93 
 
 		 135 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2575  protein of unknown function DUF302  35.71 
 
 		 144 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000565546  decreased coverage  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0357  protein of unknown function DUF302  34.13 
 
 		 143 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0138  protein of unknown function DUF302  38.76 
 
 		 135 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3638  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3831  hypothetical protein  35.88 
 
 		 140 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  38.33 
 
 		 134 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2335  hypothetical protein  39.22 
 
 		 128 aa  87.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000793507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3752  hypothetical protein  34.75 
 
 		 143 aa  85.9  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4222  protein of unknown function DUF302  44.87 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  32.54 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0825  hypothetical protein  33.7 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3436  hypothetical protein  33.7 
 
 		 149 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000030286 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  36.9 
 
 		 146 aa  65.1  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  30.89 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1248  protein of unknown function DUF302  28.7 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0155671  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  31.58 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  32.38 
 
 		 154 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0266  protein of unknown function DUF302  35.42 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2887  protein of unknown function DUF302  25.83 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1017  hypothetical protein  21.94 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.200293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1435  hypothetical protein  29.75 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.436424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2069  hypothetical protein  26.09 
 
 		 128 aa  53.1  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1854  hypothetical protein  26.09 
 
 		 127 aa  49.7  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1263  hypothetical protein  20.8 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000191336  unclonable  0.00000000979436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1269  protein of unknown function DUF302  27.96 
 
 		 154 aa  45.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1946  putative lipoprotein  29.07 
 
 		 154 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2146  hypothetical protein  23.68 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2111  hypothetical protein  21.74 
 
 		 127 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>