19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0131 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  297  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0112  hypothetical protein  98.62 
 
 		 145 aa  293  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0749559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1871  Ferritin Dps family protein  50.69 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1253  hypothetical protein  43.26 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.913362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1254  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.610184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6865  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5254  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4126  hypothetical protein  33.59 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2604  hypothetical protein  29.85 
 
 		 500 aa  53.9  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1241  hypothetical protein  31.09 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  27.86 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  25.17 
 
 		 320 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1342  hypothetical protein  29.41 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  26.23 
 
 		 148 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3040  hypothetical protein  26.97 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000290401  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  26.19 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  27.13 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>