31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1194 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0316  CRISPR-associated protein, Crm2 family  63.25 
 
 		 548 aa  714    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.182847  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1194  CRISPR-associated protein, Crm2 family  100 
 
 		 546 aa  1130    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15150  CRISPR-associated protein, Crm2 family  26.66 
 
 		 676 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1484  Cmr2 family CRISPR-associated protein  26.09 
 
 		 488 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.752806  normal  0.296807 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3380  CRISPR-associated protein, Cmr3  26.67 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.879462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1658  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.55 
 
 		 731 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1026  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.12 
 
 		 812 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2692  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  26.75 
 
 		 612 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0964  CRISPR-associated Cmr2 family protein  26.54 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.662431  normal  0.765777 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0658  CRISPR-associated protein, Crm2 family  24.06 
 
 		 569 aa  99.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1823  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.37 
 
 		 607 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2979  CRISPR-associated protein, Crm2 family  34.48 
 
 		 623 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.113889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0700  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  28.35 
 
 		 616 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00738894  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0649  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  35.33 
 
 		 638 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1317  CRISPR-associated protein, Crm2 family  38.27 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0263  CRISPR-associated Cmr2 family protein  34.6 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2297  CRISPR-associated protein, Crm2 family  36.3 
 
 		 616 aa  75.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0627  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  31.55 
 
 		 977 aa  72.4  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.397763  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1791  CRISPR-associated protein, Crm2 family  35.85 
 
 		 637 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.175791  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1951  CRISPR-associated protein, Crm2 family  31.46 
 
 		 624 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1987  CRISPR-associated Csm1 family protein  27.38 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1578  CRISPR-associated Cmr2 family protein  29.9 
 
 		 594 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0579  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  30.65 
 
 		 628 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.638626  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0106  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  29.49 
 
 		 528 aa  54.7  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1072  hypothetical protein  26.18 
 
 		 542 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1097  metal dependent phosphohydrolase  33.09 
 
 		 735 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0563  CRISPR-associated RAMP Crm2 family protein  25.68 
 
 		 898 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.406769  hitchhiker  0.00098252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3294  hypothetical protein  26.73 
 
 		 542 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0272  CRISPR-associated Cmr2 family protein  30.37 
 
 		 935 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1009  CRISPR-associated Csm1 family protein  30.88 
 
 		 717 aa  46.6  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5328  hypothetical protein  23.64 
 
 		 540 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.213692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>