More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2741 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2741  t-RNA-binding domain protein  100 
 
 
201 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00906438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0691  t-RNA-binding domain protein  80.1 
 
 
201 aa  328  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4825  putative tRNA binding domain protein  68.66 
 
 
201 aa  294  8e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00270111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4804  putative tRNA binding domain protein  68.16 
 
 
204 aa  292  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4809  putative tRNA binding domain protein  68.16 
 
 
204 aa  292  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4834  tRNA-binding domain-containing protein  68.16 
 
 
204 aa  292  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4587  tRNA-binding domain-containing protein  68.16 
 
 
204 aa  292  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4424  tRNA-binding-domain-containing protein  68.16 
 
 
204 aa  292  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4442  tRNA-binding-domain-containing protein  68.16 
 
 
204 aa  292  3e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.128672  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4943  tRNA-binding domain-containing protein  68.16 
 
 
204 aa  292  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3353  tRNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
201 aa  288  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0432  putative tRNA binding domain protein  66.67 
 
 
204 aa  286  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4523  tRNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
201 aa  284  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1832  tRNA-binding domain-containing protein  57.29 
 
 
198 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.448228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1797  tRNA-binding domain-containing protein  57.29 
 
 
198 aa  206  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1302  hypothetical protein  56.5 
 
 
198 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000484296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1824  EMAP domain-containing protein  46.73 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000678669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0436  EMAP domain-containing protein  45.77 
 
 
208 aa  168  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0178  tRNA-binding domain-containing protein  41.84 
 
 
208 aa  165  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1436  EMAP domain-containing protein  44.83 
 
 
215 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.180074  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0707  EMAP domain-containing protein  40.2 
 
 
218 aa  145  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653747  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1251  tRNA-binding domain-containing protein  42.29 
 
 
215 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000609794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2634  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  63.73 
 
 
800 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.509439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0979  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.78 
 
 
805 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.126916 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0517  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62.04 
 
 
778 aa  122  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1270  EMAP domain-containing protein  37.56 
 
 
203 aa  121  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.514449  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0975  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.05 
 
 
773 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0485  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.23 
 
 
772 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0917  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  62 
 
 
773 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0712  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  57.43 
 
 
798 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.11193  normal  0.589363 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0484  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.73 
 
 
801 aa  118  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.376458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2992  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  57.55 
 
 
793 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0905  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.27 
 
 
773 aa  115  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0610  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50 
 
 
779 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0755982  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0426  putative phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.89 
 
 
876 aa  110  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.333075  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0870  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.68 
 
 
778 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.44 
 
 
800 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1253  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  57.73 
 
 
778 aa  109  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.434071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.44 
 
 
800 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1193  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.97 
 
 
776 aa  108  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.18222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
801 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.417959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.47 
 
 
799 aa  107  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.57 
 
 
814 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.49 
 
 
801 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00584126  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0182  putative tRNA binding domain protein  34 
 
 
198 aa  106  2e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14801  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.3 
 
 
815 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0967286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.64 
 
 
815 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3020  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.85 
 
 
796 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1341  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.29 
 
 
810 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2648  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.19 
 
 
804 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0425  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.43 
 
 
779 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1816  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  53.45 
 
 
819 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.597533  normal  0.483495 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2221  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  65.88 
 
 
810 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.64 
 
 
815 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.75 
 
 
809 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.3 
 
 
809 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1339  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.57 
 
 
807 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.217856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1642  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.3 
 
 
809 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2225  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.57 
 
 
801 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000627818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.49 
 
 
792 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.49 
 
 
792 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.57 
 
 
801 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3524  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.83 
 
 
800 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0722  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54 
 
 
800 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.898313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
810 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
809 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
809 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1520  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.98 
 
 
801 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
809 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
809 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1135  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.99 
 
 
807 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.320501  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
809 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.79 
 
 
809 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.46 
 
 
814 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.68 
 
 
809 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.46 
 
 
814 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1142  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.27 
 
 
810 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.93 
 
 
795 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
810 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 
810 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.51 
 
 
792 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0280  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  49.09 
 
 
807 aa  99  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.46 
 
 
839 aa  99  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.17 
 
 
811 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.17 
 
 
811 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.7 
 
 
790 aa  98.6  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 
792 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1423  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.46 
 
 
804 aa  98.2  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0017592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.48 
 
 
793 aa  98.2  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl589  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.57 
 
 
193 aa  98.2  8e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.655316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  50.5 
 
 
789 aa  97.1  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.06 
 
 
793 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1930  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  51.82 
 
 
804 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0326717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.62 
 
 
815 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>