14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2967 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2967  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  330  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1315  hypothetical protein  38.27 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.155182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0430  rubrerythrin  40.74 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0468  rubrerythrin  34.36 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2291  rubrerythrin  38.89 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.683509  normal  0.317377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2193  hypothetical protein  33.95 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1311  Rubrerythrin  31.85 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000177343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2914  Rubrerythrin  33.54 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1897  hypothetical protein  29.27 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00778692  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  31.9 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3086  Rubrerythrin  31.29 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1509  hypothetical protein  29.66 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2707  hypothetical protein  30.34 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000186708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2111  hypothetical protein  27.16 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>