35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2397 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2397  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  98 
 
 		 220 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  64 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  56 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  55.1 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  58.14 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  57.14 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3397  hypothetical protein  47.62 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0790  hypothetical protein  44.9 
 
 		 232 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.513436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  44.9 
 
 		 232 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  52.5 
 
 		 235 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  42.86 
 
 		 234 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  50 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  50 
 
 		 226 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  45.24 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  48.98 
 
 		 239 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  39.58 
 
 		 232 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  55 
 
 		 216 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0708  protein of unknown function DUF1568  40.82 
 
 		 233 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.615013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  40 
 
 		 230 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  40 
 
 		 236 aa  43.9  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1552  protein of unknown function DUF1568  47.62 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  47.62 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  45.24 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0267  transposase and inactivated derivatives  44.9 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0740  hypothetical protein  42.22 
 
 		 255 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.345588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  36.73 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  43.75 
 
 		 322 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0207  hypothetical protein  36.96 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0203  hypothetical protein  36.96 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0201  hypothetical protein  36.96 
 
 		 288 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0033  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3508  hypothetical protein  40.82 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3321  hypothetical protein  41.3 
 
 		 69 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>