25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1283 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1283  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1475  hypothetical protein  56.45 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3635  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3585  hypothetical protein  50 
 
 		 172 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0793  hypothetical protein  56.1 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2815  hypothetical protein  50.4 
 
 		 174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3066  hypothetical protein  45.87 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1835  hypothetical protein  37.9 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.74509  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0678  twin-arginine translocation pathway signal  32.75 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.968333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1830  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.314106  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  29.41 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0502  hypothetical protein  35.25 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  36.21 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  26.74 
 
 		 918 aa  61.6  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1552  hypothetical protein  28.32 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0038009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  32.52 
 
 		 350 aa  53.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  31.9 
 
 		 378 aa  52.4  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  35.94 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  26.5 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1448  hypothetical protein  26.32 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  34.13 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  26.77 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  33.08 
 
 		 165 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  30.19 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  32.54 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>