69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2859 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 151 aa  303  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  96.69 
 
 		 151 aa  296  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.66 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  41.01 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.43 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  41.26 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  44.12 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  42.03 
 
 		 143 aa  116  9e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  44.29 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  39.44 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.86 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.72 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  40.28 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  39.13 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.59 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.73 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  39.01 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.01 
 
 		 143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  39.13 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  41.84 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  40.41 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  38.73 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  40.71 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.16 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  41.13 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  40 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  40 
 
 		 147 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  38.3 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  38.3 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.03 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.96 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.67 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  41.3 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.88 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  33.09 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.82 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  35.71 
 
 		 142 aa  91.3  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.27 
 
 		 141 aa  89.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  37.14 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.75 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.75 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.04 
 
 		 141 aa  87.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  31.39 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.06 
 
 		 142 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  34.35 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  35.46 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  34.06 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  33.57 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.85 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  40.38 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  29.86 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  27.94 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  32.04 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  28.67 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  33.98 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  31.68 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  32.04 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0326  hypothetical protein  31.78 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.67 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.78 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  33 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1309  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.98 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>