29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7299 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  100 
 
 		 263 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  73.81 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  32.37 
 
 		 429 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  32.23 
 
 		 467 aa  105  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  32.24 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  29 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  33.48 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  37.04 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  23.95 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  25.24 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  28.37 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3673  hypothetical protein  30.95 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2238  hypothetical protein  41.77 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.578403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3326  hypothetical protein  39.33 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  33.07 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2121  hypothetical protein  40.51 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.608641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2354  NERD domain-containing protein  40.51 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.941853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2107  NERD domain protein  40.51 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.661217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1330  NERD domain protein  44.83 
 
 		 540 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0627  hypothetical protein  32.69 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  43.86 
 
 		 232 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1050  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0849  NERD domain protein  26.97 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3235  NERD domain protein  26.92 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0000235763  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  25.33 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0004  hypothetical protein  29.91 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0005  hypothetical protein  32.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0131  hypothetical protein  32.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  35.06 
 
 		 341 aa  42  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>