51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5755 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5755  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
85 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  40.54 
 
 
79 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2091  acyl carrier protein  40.91 
 
 
79 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1361  acyl carrier protein  38.67 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000207547  normal  0.0506091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  36.99 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0944  acyl carrier protein  35.53 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000174331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5351  acyl carrier protein  38.89 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  41.33 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  36.84 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  37.33 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  39.19 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  37.33 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3512  acyl carrier protein  43.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0949  acyl carrier protein  43.75 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000253013  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  39.19 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1641  acyl carrier protein  34.25 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  41.27 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4067  acyl carrier protein  31.17 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  41.27 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  41.27 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3914  acyl carrier protein  40.91 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0883  acyl carrier protein  36.99 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000242851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3647  acyl carrier protein  37.66 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0742845  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  35.06 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  37.31 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  42.19 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  35.14 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  33.33 
 
 
75 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  36 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1515  phosphopantetheine-binding  37.88 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.159664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0752  acyl carrier protein  41.94 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103187  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0230  acyl carrier protein  42.86 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  36.99 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  33.8 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  34.67 
 
 
77 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0283  acyl carrier protein, ACP  30.16 
 
 
78 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1160  acyl carrier protein  31.25 
 
 
84 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0779  phosphopantetheine-binding protein  28.95 
 
 
76 aa  42  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  35.14 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1173  phosphopantetheine-binding  32.43 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5148  acyl carrier protein  41.94 
 
 
79 aa  41.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.166001 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0658  phosphopantetheine-binding  30.99 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00184393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  36.49 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  43.33 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  34.67 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  33.33 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  36.49 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  32 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  36.11 
 
 
77 aa  40  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0225  acyl carrier protein  42.86 
 
 
81 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.623939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2415  phosphopantetheine-binding  41.54 
 
 
80 aa  40  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>