16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5082 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5082  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 302 aa  560  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1430  hypothetical protein  75.6 
 
 		 280 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287279  normal  0.0390822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1056  ABC-2 type transporter  50.62 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.655499  normal  0.0850571 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0475  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0589  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2825  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18060  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28460  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 245 aa  47  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.373248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0737  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.14 
 
 		 377 aa  46.2  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00484474  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30630  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.23 
 
 		 273 aa  46.2  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  21.82 
 
 		 377 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1630  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.68052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2394  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  30.91 
 
 		 252 aa  42.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.220464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>