20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4528 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4528  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 373 aa  736    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.65 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0557769  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27320  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.71 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.572933 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 		 328 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  20.88 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 		 330 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 		 336 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1570  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.18 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0171  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.7 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 		 334 aa  46.6  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.77 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.32 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  23.05 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.809623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>