25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4150 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4038  transposase-like protein  44.87 
 
 		 570 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.522905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3856  transposase-like protein  44.87 
 
 		 570 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2540  transposase-like protein  44.87 
 
 		 570 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.184264 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1836  transposase-like protein  44.87 
 
 		 570 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.659926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0359  transposase-like protein  44.87 
 
 		 570 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1901  transposase  46.27 
 
 		 586 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0330742  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0621  transposase IS4 family protein  39.44 
 
 		 575 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  hitchhiker  0.00000449276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  38.67 
 
 		 562 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0389  transposase, IS4 family protein  37.93 
 
 		 562 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1129  transposase, IS4 family protein  37.93 
 
 		 562 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  36.44 
 
 		 594 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  36.44 
 
 		 548 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  36.44 
 
 		 548 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  36.44 
 
 		 548 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0784  transposase, IS4 family protein  34.18 
 
 		 562 aa  47.8  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0348  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 566 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0178461  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1977  transposase  30.99 
 
 		 555 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000110578  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 		 596 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 		 596 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2638  transposase, IS4 family protein  29.47 
 
 		 563 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2631  transposase, IS4 family protein  29.35 
 
 		 487 aa  40.8  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  30.56 
 
 		 596 aa  40.4  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1382  transposase, IS4 family protein  29.35 
 
 		 563 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1993  transposase, IS4 family protein  29.35 
 
 		 509 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.458158  normal  0.851363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>