23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3163 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3163  putative transposase  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4166  integrase  68.37 
 
 		 228 aa  131  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  68.37 
 
 		 213 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  64.29 
 
 		 262 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4096  IS6 family transposase  65.31 
 
 		 175 aa  123  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6782  hypothetical protein  63.27 
 
 		 132 aa  123  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7084  integrase catalytic region  64.29 
 
 		 169 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  62.24 
 
 		 213 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  62.07 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4446  integrase catalytic region  62.07 
 
 		 175 aa  103  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  61.63 
 
 		 236 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  59.3 
 
 		 236 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  57.14 
 
 		 237 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  56.12 
 
 		 236 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  57.14 
 
 		 237 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  53.01 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2530  hypothetical protein  70.83 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0477  putative transposase  57.41 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3733  hypothetical protein  65.79 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4638  hypothetical protein  71.88 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1778  transposase  50 
 
 		 250 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.887632  normal  0.245657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7111  putative transposase  76.92 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.752009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  37.74 
 
 		 302 aa  40.4  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>