14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2905 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1107  transposase  91.54 
 
 
549 aa  1002    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  100 
 
 
544 aa  1098    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2929  hypothetical protein  99.56 
 
 
227 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  51.91 
 
 
409 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  51.91 
 
 
409 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  53.11 
 
 
376 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3065  transposase  60.19 
 
 
444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  37.12 
 
 
369 aa  117  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  36.94 
 
 
221 aa  110  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0332  transposase  27.6 
 
 
230 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0013  transposase  28.22 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1754  hypothetical protein  28.12 
 
 
230 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1970  hypothetical protein  28.12 
 
 
230 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2322  hypothetical protein  27.6 
 
 
230 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.129316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>