11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2876 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  100 
 
 
369 aa  739    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  99.55 
 
 
221 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1107  transposase  37.77 
 
 
549 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2929  hypothetical protein  37.55 
 
 
227 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  37.12 
 
 
544 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  49.33 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  49.33 
 
 
409 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  60 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  35.54 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  36.92 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  35.54 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>