15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0018 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  100 
 
 
376 aa  774    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  82.71 
 
 
409 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  82.71 
 
 
409 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1107  transposase  52.49 
 
 
549 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  52.21 
 
 
544 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3065  transposase  50.15 
 
 
444 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0039  hypothetical protein  31.75 
 
 
160 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000394953  normal  0.0123799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  60 
 
 
369 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2929  hypothetical protein  62.22 
 
 
227 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  61.54 
 
 
221 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0332  transposase  26.34 
 
 
230 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0013  transposase  25.76 
 
 
230 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1754  hypothetical protein  26.02 
 
 
230 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1970  hypothetical protein  26.02 
 
 
230 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2322  hypothetical protein  25.51 
 
 
230 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.129316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>