12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3067 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  99.55 
 
 		 369 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1107  transposase  37.61 
 
 		 549 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2929  hypothetical protein  36.94 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  36.94 
 
 		 544 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  50.72 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  50.72 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  61.54 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  36.92 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  35.54 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  35.54 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  34.09 
 
 		 258 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>