15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2310 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  100 
 
 
409 aa  844    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  100 
 
 
409 aa  844    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  83.43 
 
 
376 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1107  transposase  52.67 
 
 
549 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  51.91 
 
 
544 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3065  transposase  47.89 
 
 
444 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2929  hypothetical protein  53.33 
 
 
227 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  49.33 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  50.72 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0332  transposase  28.18 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0013  transposase  27.85 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1754  hypothetical protein  27.85 
 
 
230 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1970  hypothetical protein  27.85 
 
 
230 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2322  hypothetical protein  27.4 
 
 
230 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.129316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0039  hypothetical protein  28.8 
 
 
160 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000394953  normal  0.0123799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>