15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1107 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1107  transposase  100 
 
 		 549 aa  1103    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  91.54 
 
 		 544 aa  1002    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2929  hypothetical protein  90.75 
 
 		 227 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  52.12 
 
 		 409 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  52.12 
 
 		 409 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  53.39 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3065  transposase  62.65 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2876  hypothetical protein  37.77 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3067  hypothetical protein  37.61 
 
 		 221 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0013  transposase  28.65 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0332  transposase  27.6 
 
 		 230 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1754  hypothetical protein  28.65 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1970  hypothetical protein  28.65 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2322  hypothetical protein  28.12 
 
 		 230 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.129316  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0039  hypothetical protein  24.77 
 
 		 160 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000394953  normal  0.0123799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>