13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3065 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3065  transposase  100 
 
 
444 aa  898    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1107  transposase  62.65 
 
 
549 aa  385  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.373309  normal  0.299253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2905  transposase  60.19 
 
 
544 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0018  transposase  52.58 
 
 
376 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1507  transposase family protein  49.1 
 
 
409 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2310  transposase family protein  49.1 
 
 
409 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00940925  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0039  hypothetical protein  28.15 
 
 
160 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000394953  normal  0.0123799 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0013  transposase  25.36 
 
 
230 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4178  hypothetical protein  31.45 
 
 
162 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.121011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0332  transposase  23.74 
 
 
230 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1754  hypothetical protein  25.36 
 
 
230 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1970  hypothetical protein  25.36 
 
 
230 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2322  hypothetical protein  25.36 
 
 
230 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.129316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>