24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1332 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
1066 aa  2085    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  45.47 
 
 
1009 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  41.25 
 
 
1074 aa  521  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  37.78 
 
 
1027 aa  512  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  38.88 
 
 
1029 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.73 
 
 
1021 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  39.67 
 
 
1031 aa  456  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  35.65 
 
 
1035 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.04 
 
 
1042 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  38.05 
 
 
729 aa  357  5.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.62 
 
 
915 aa  274  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  28.69 
 
 
968 aa  216  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  29.12 
 
 
964 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  36.8 
 
 
373 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.43 
 
 
1060 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.58 
 
 
1013 aa  128  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.9 
 
 
1042 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  27.4 
 
 
1038 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.12 
 
 
1036 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.62 
 
 
1148 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  32.31 
 
 
987 aa  101  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.34 
 
 
1055 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.03 
 
 
757 aa  63.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0557  hypothetical protein  32 
 
 
317 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.351374 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>