15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0842 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0842  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0340  hypothetical protein  48.21 
 
 
355 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.586922  normal  0.321753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2338  hypothetical protein  47.27 
 
 
358 aa  285  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000404345  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2476  GCN5-related N-acetyltransferase  46.87 
 
 
523 aa  268  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1738  hypothetical protein  43.75 
 
 
383 aa  262  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.587497  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4234  hypothetical protein  47.72 
 
 
369 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.768342  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1724  lipocalin-like protein  40.97 
 
 
362 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.124469 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0176  hypothetical protein  32.33 
 
 
320 aa  119  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1710  hypothetical protein  28.52 
 
 
335 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0504  hypothetical protein  31.75 
 
 
340 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4005  hypothetical protein  29.91 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215116  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1321  hypothetical protein  27.78 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3228  hypothetical protein  26.15 
 
 
358 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.445025  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1322  hypothetical protein  28.72 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  20.27 
 
 
319 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>