20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0577 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1854  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0349  hypothetical protein  45.22 
 
 		 278 aa  191  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2428  hypothetical protein  45.45 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7418  hypothetical protein  45.19 
 
 		 274 aa  185  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1563  hypothetical protein  43.98 
 
 		 249 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688217  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4528  hypothetical protein  46.72 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4766  hypothetical protein  39.18 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0369  hypothetical protein  37.36 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03250  hypothetical protein  37.04 
 
 		 251 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10050  hypothetical protein  34.29 
 
 		 273 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.695793  normal  0.554236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1967  hypothetical protein  34.44 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0078647  normal  0.0152581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6794  hypothetical protein  33.07 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02380  hypothetical protein  32.56 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3675  hypothetical protein  29.58 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06150  hypothetical protein  26.12 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0284078  hitchhiker  0.0068858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0575  hypothetical protein  27.24 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2954  hypothetical protein  27.21 
 
 		 297 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3703  hypothetical protein  27.11 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3048  hypothetical protein  25.09 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>