19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4351 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  917    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  64.79 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  31.15 
 
 		 263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7299  NERD domain-containing protein  32.92 
 
 		 263 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0313277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  30.41 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  26.85 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  24.19 
 
 		 275 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  23.25 
 
 		 270 aa  52.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  28.42 
 
 		 265 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  25.12 
 
 		 262 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1939  NERD domain-containing protein  25.61 
 
 		 700 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00843241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3808  hypothetical protein  35.14 
 
 		 331 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  32.95 
 
 		 257 aa  46.2  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3609  hypothetical protein  26 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0788453  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1359  NERD domain protein  25.95 
 
 		 248 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4129  NERD domain protein  36.11 
 
 		 232 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0312  NERD domain protein  25.81 
 
 		 256 aa  43.5  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000707319  normal  0.0160162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  32.17 
 
 		 253 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>