56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4173 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  557  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4072  hypothetical protein  78.71 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000279639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  67.68 
 
 		 271 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  49.24 
 
 		 262 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0200  hypothetical protein  25.98 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  25.37 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3500  hypothetical protein  28.27 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3208  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0366  hypothetical protein  25.49 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191928  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0239  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.644055  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0443  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00928843  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0606  hypothetical protein  25.49 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1354  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0073  hypothetical protein  25.49 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0424  hypothetical protein  25.49 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4658  hypothetical protein  26 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6152  hypothetical protein  25 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0486  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0607779 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  27 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104382 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4230  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5164  hypothetical protein  25.37 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0479  hypothetical protein  27.01 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.323829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2294  hypothetical protein  24.51 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2923  hypothetical protein  24.51 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2908  hypothetical protein  24.51 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0570741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6251  hypothetical protein  24.51 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0163  hypothetical protein  25.37 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0308  hypothetical protein  25.37 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0396  hypothetical protein  24.51 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289257  normal  0.0165478 
 
 
-
 
NC_003296  RS02215  hypothetical protein  26 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0170  hypothetical protein  25.37 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0107  hypothetical protein  25.37 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2957  hypothetical protein  24.51 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2820  hypothetical protein  24.51 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239639  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0484  hypothetical protein  26.54 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3911  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0451  hypothetical protein  27.01 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0077  hypothetical protein  24.88 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.490131 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6491  hypothetical protein  24.51 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.725464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0199  hypothetical protein  26.95 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6000  hypothetical protein  24.51 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5635  hypothetical protein  24.51 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0378  Conserved hypothetical protein. putative conserved domain  26.95 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00161389  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7409  hypothetical protein  24.02 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  25.6 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  25.73 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19440  hypothetical protein  28.57 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.577003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  25.79 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  25 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  24.71 
 
 		 275 aa  42  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>