45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0308 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0308  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0170  hypothetical protein  96.13 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0163  hypothetical protein  95.77 
 
 		 284 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0107  hypothetical protein  90.66 
 
 		 284 aa  540  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0077  hypothetical protein  89.44 
 
 		 286 aa  534  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.490131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0073  hypothetical protein  84.08 
 
 		 291 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0606  hypothetical protein  84.08 
 
 		 291 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3208  hypothetical protein  84.08 
 
 		 288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0443  hypothetical protein  84.08 
 
 		 288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00928843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0424  hypothetical protein  84.08 
 
 		 288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1354  hypothetical protein  84.08 
 
 		 288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0239  hypothetical protein  84.08 
 
 		 288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.644055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0366  hypothetical protein  84.08 
 
 		 291 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2294  hypothetical protein  82.01 
 
 		 292 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2923  hypothetical protein  82.01 
 
 		 292 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748941 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2908  hypothetical protein  82.01 
 
 		 292 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0570741  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2957  hypothetical protein  82.01 
 
 		 292 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4230  hypothetical protein  83.04 
 
 		 290 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2820  hypothetical protein  82.01 
 
 		 292 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239639  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0486  hypothetical protein  82.7 
 
 		 290 aa  508  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0607779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6251  hypothetical protein  82.01 
 
 		 292 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0396  hypothetical protein  82.7 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289257  normal  0.0165478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0200  hypothetical protein  84.78 
 
 		 290 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6152  hypothetical protein  82.27 
 
 		 283 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5635  hypothetical protein  82.5 
 
 		 283 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6000  hypothetical protein  82.5 
 
 		 283 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6491  hypothetical protein  82.73 
 
 		 283 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.725464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7409  hypothetical protein  82.91 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  76.95 
 
 		 295 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4658  hypothetical protein  76.82 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5164  hypothetical protein  80.43 
 
 		 285 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  81.25 
 
 		 287 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3911  hypothetical protein  79.5 
 
 		 289 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0451  hypothetical protein  72.79 
 
 		 287 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0484  hypothetical protein  72.79 
 
 		 287 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0479  hypothetical protein  72.79 
 
 		 287 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.323829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0378  Conserved hypothetical protein. putative conserved domain  69.75 
 
 		 285 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00161389  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0199  hypothetical protein  69.75 
 
 		 285 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3500  hypothetical protein  72.12 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02215  hypothetical protein  57.3 
 
 		 273 aa  332  4e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4072  hypothetical protein  26.37 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000279639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  25.37 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  25.46 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  26.35 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  24.86 
 
 		 309 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>